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外显子测序技术联盟提升遗传病诊治能力

来源:南京晨报  

每年2月28日是国际罕见病日,数据显示我国有2000多万罕见病患者,其中儿童占到相当大的比例。那么,什么是罕见病?罕见病可以预防吗?带着问题,记者走进南京市妇幼保健院遗传医学中心。

孩子接连夭折,基因检测“揪出”原因

幸福的家庭都是相似的,不幸的家庭各有各的不幸。连续三个孩子的出生缺陷使王女士(化姓)夫妇的生活雪上加霜。

王女士于2008年顺产一子,生后夭折;2010年顺产一子,脑发育不良,脊柱异常,2岁夭折;现有一子,2岁,全面发育迟缓,智力低下,四肢僵硬,脊柱外观异常,脐疝,畸形足,关节异常,不能独坐和走路,牙齿畸形,心脏异常。

满脸愁容的王女士夫妇不远千里,带其2岁的儿子来到了南京市妇幼保健院遗传咨询与产前诊断门诊。南京市妇幼保健院副院长许争峰经详细问诊,考虑到王女士的多次不良孕产史以及患儿的多发畸形,建议患儿与父母同时进行外显子测序检测寻找病因。

果不其然,基因检测发现患儿存在GNPTAB基因的一个纯合突变,该变异会导致粘脂贮积症II α/β型/I细胞病,引起患儿全面发育迟缓、面部、骨骼、心脏等多方面异常,该病发病率极低却在这个家庭连续发生了三次。

检测结果无疑给这个家庭带来了巨大的希望,再次妊娠该夫妇选择进行胚胎植入前产前诊断,最终生育了一个健康的孩子。

父母携带突变基因,两个孩子相继“中招”

怀孕16周的郭女士(化姓)对自己腹中胎儿非常焦虑,因为此前她生育的两胎都是脑瘫患儿。担心同样的噩梦再次重演,郭女士带着两个孩子来到南京市妇幼保健院就诊。

该院遗传医学中心主任罗春玉对其耐心安慰和问询,了解到郭女士大女儿12岁,出生3个月后因肺炎住院一周,出院后四肢无力,无法行走,且至今无语言交流能力。而10岁的二女儿,同样在出生后3个月因发烧、肺炎住院后出现脑瘫,身体抵抗力差。两姐妹均有手足姿势异常,时有癫痫发作。

再次怀孕的郭女士十分焦虑,沉重的家庭重担已不允许他们再生育一个脑瘫患儿。考虑到连续生育两个表型相同的患儿,罗主任建议其进行外显子测序检测。测序确定了两姐妹存在TH基因的复合杂合突变,父母均为携带者,发病率仅在百万分之一到百万分之九之间。

根据症状或疾病征象严重程度,两姐妹均属于最严重的TH缺乏型进行婴儿型脑病(3型)。患病后的两姐妹生活极为不便,也给他们的家庭带来了沉重负担。若能及时确诊,采用药物干预,两姐妹的症状可能会有所缓解。

郭女士此次妊娠仍有25%的患病风险,在孕20周时,接受羊水穿刺和产前基因诊断,所幸该胎儿为一个携带者。得知并不会出现两姐妹的症状后,郭女士心里的大石头终于落地了。

外显子测序技术是怎么回事

专家介绍,外显子测序技术(Exome Sequencing,ES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕获富集后进行高通量测序。外显子区域虽然仅占全基因组序列的1%,却包含了85%的致病突变,与多种疾病的发生息息相关。

对于遗传病的诊断,ES是目前临床上最常用的诊断方法,可全面检测及分析已知编码基因外显子区域约20000个基因信息,凭借检测高效全面、诊断率高、极高价比等优势,在罕见遗传病尤其是单基因遗传病的临床诊断中发挥着重要作用。

在遗传疾病方面主要应用于儿童和成人基因不明确的遗传病可检测,如:

结构异常:头面部发育异常、躯干、四肢和生殖器的先天异常、内脏异位、多发内脏先天畸形等;

功能异常:神经肌肉疾病,如智力、语言、认知障碍、癫痫等;视听障碍;先天代谢障碍,不明原因的新生儿反应差、肌张力低下、喂养困难;免疫系统功能明显异常等。

产前诊断:胎儿单一结构异常或多发畸形;曾生育过单一结构异常或多发畸形(提示为遗传病因)而未诊断的胎儿,本次胎儿有相似表型,而核型或CMA为阴结果;原因不明的反复死胎,而核型和/或CMA检测阴,且当前妊娠胎儿具有相似的表型异常。

外显子测序技术联盟提升遗传病诊治能力

南京市妇幼保健院遗传医学中心自2017年开展全外显子组测序,完成千余例患者或胎儿的检测,为200余例患者找到了遗传学病因。该项目的开展有助于进一步降低我国的出生缺陷发生率,造福更多家庭。为更好地服务于遗传病患者或有产前诊断需求的孕妇,让患者能就得到优质医疗服务,由南京市妇幼保健院遗传医学中心牵头,与江苏、安徽、山东和福建等地40余家医院加强地域合作,成立外显子测序技术联盟,旨在进一步促进测序技术支持与共享,努力推动基因测序技术产业发展,提升解决遗传病的诊治能力。

关键词: 遗传病诊治 测序技术联盟 外显子测序 遗传病诊治能力

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