中国获得国际首个组装到染色体水平的家驴基因组参考图谱

12月9日，《自然》子刊《自然·通讯》发表了中国科研团队的一篇遗传学研究论文。中国科学家联合国内外多家单位，成功破译了德州驴基因组，获得国际首个组装到染色体水平的家驴基因组参考图谱。

作为中国五大优良驴种之一，德州驴个体大、皮厚、出胶率高，是熬制阿胶的上等原料。

为深入挖掘德州驴的遗传资源，山东省农科院联合东阿阿胶股份有限公司于2014年底联合发起了“德州驴基因组开发及其产业化应用”项目，经过5年多不懈攻关，最终构建了德州驴染色体水平的高质量参考基因组图谱。

家驴的起源与驯化历史一直以来存在争议。该研究团队采集了9个国家的126头家驴、1头非洲野驴和6头亚洲野驴样品，通过全基因组重测序检测了大量的基因组遗传变异。通过系统进化分析和主成分分析，可以明确世界上所有家驴均起源于非洲野驴。种群遗传关系分析进一步表明热带非洲家驴群体与非洲野驴关系更紧密，埃及家驴群体次之，这表明家驴可能驯化于热带非洲，随后通过埃及扩散到欧洲、中亚及东亚。

该团队发现家驴在演化早期具有与非洲野驴相似的种群变化历史，而家驴在从非洲野驴中分离出来后，不同群体间仍然具有高度相似的种群演化历史，说明家驴的起源比较单一。

父系遗传物质和母系遗传物质对于群体演化历史研究具有重要的价值，研究团队成功组装了家驴的Y染色体并构建了家驴群体父系遗传物质的系统进化树，同时根据线粒体变异位点构建了母系遗传物质的系统进化树。发现母系遗传物质中除了索马里野驴成分外还可能存在努比亚野驴成分，父系遗传物质可能在驯化过程中受到人类喜好的影响只来自于少数几个雄性个体。

德州驴基因组不仅为马属动物的起源进化研究提供了数据基础，也为优良遗传资源保护和利用、家驴基因组选择育种和遗传改良、家驴分子设计育种提供了数据支撑。

关键词： 中国